Arxsys中央控制管理系统是整个Arxsys的管理中心，用户可以用相应的帐号和密码进入管理模块，管理的功能包括有对用户进行管理，对模拟病房进行设置，对示教室申请观摩教学进行授权处理，课程录制内容进行分类管理等功能。

在教学过程中，中央控制室可以看到每一个模拟病房进行示教的画面，在模拟病房或示教室提出要求后，中控室的管理人员可以介入进行双向交谈，并提供相应的协助和服务，让直播示教可以顺利进行。

同时允许多个教学活动并发进行也是Arxsys系统的特色之一，支持完全基于Web的中央管理模块，在使用过程中，用户可以通过Web方式对模拟病房、课程录制、用户帐号等进行详细的分类管理。避免使用中产生的资源冲突，也能更好的记录模拟病房或示教室的使用状况。更合理的利用现有的资源来进行更有效的互动交流活动。